João Fernandes (Bragança, 1964) ha pres possessió del càrrec de subdirector de Conservació, Investigació i Difusió del Museu Nacional Centre d'Art Reina Sofia, en substitució de Lynne Cooke, que ocupava el lloc des de 2008. Fernandes és llicenciat en Llengües i Literatures Modernes per la Universitat de Porto i compta amb estudis de postgrau de la Universitat de Lisboa. El 2003 va ser nomenat director del Museu Serralves on ha programat i comissariat exposicions d'artistes com Eduardo Batarda, Dara Birnbaum, Lourdes Castro, François Dufrêne, Barry Li Va, Manoel de Oliveira, Júlio Pomar, Robert Rauschenberg, Paula Rego o Alvaro Siza, Com director adjunt del Museu Serralves, càrrec que va ocupar anteriorment, entre 1996 i 2003, va organitzar exposicions sobre l'obra de Tacita Dean, Pierre Huyghe, Fernando Lanhas, Alburquerque Mendes, Lygia Pape, Joana Vasconcelos o João Vieira.
En els seus inicis professionals, a més de la seva tasca docent en l'Istituto Politècnic do Porto (1987-1995), va treballar com a comissari independent, organitzant les Jornades d'Art Contemporânea de Porto (1992-1996), en què es van presentar per primera vegada a Portugal obres d'artistes com Christine Borland, Douglas Gordon, Richard Long o Rirkrit Tiravanija. Va organitzar i comissariar la representació portuguesa de la primera Biennal de Johannesburg (1995), la 24aª Biennal d'Art de São Paulo (2003) i, conjuntament amb Vicente Todolí, la 50à Biennal de Venècia (2003).
Des de 2004 coordina la programació del Festival d'Arts Visuals i performatives Serralves em Festa. Ha estat membre del jurat a l'École Nationale Supérieure des Beaux-Arts de París (2005) i del Jurat Internacional de Selecció de Comissari de la Biennal de São Paulo (2006). Així mateix, ha comissariat nombroses mostres amb la Col·lecció de la Fundação Serralves en diverses ciutats, tant a Portugal com en altres països. En la seva faceta acadèmica, Fernandes ha col·laborat amb diferents institucions: Universitat de Lisboa, Universitat de Coïmbra, Universitat de Porto, Complutense de Madrid o la Universitat de Santiago de Compostel·la.
João Fernandes és membre del Conselho Geral dóna Universidade do Minho i del Conselho de Representants dóna Faculdade de Belas Artes de Porto i dóna Faculdade de Arquitectura de Porto, així com del IKT (Internationale Kunstausstellungsleiter - Tagung).